Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk2a1Q60737 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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