Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ItgaeQ60677 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ItgaeQ60677 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms