Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms