Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d4Q5RJF7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms