Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051142Q3V0M8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC051142Q3V0M8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms