Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnpc3Q3UZ01 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms