Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ccdc160Q3UYG1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms