Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Capn13Q3UW68 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Capn13Q3UW68 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms