Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rmdn3Q3UJU9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rmdn3Q3UJU9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms