Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx27Q3UHD6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snx27Q3UHD6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx27Q3UHD6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms