Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pid1Q3UBG2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pid1Q3UBG2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms