Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trip13Q3UA06 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trip13Q3UA06 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms