Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud5Q3U2S4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Otud5Q3U2S4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms