Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rufy4Q3TYX8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms