Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrx1Q3TL44 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrx1Q3TL44 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms