Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms