Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trappc13Q3TIR1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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