Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnma1Q08460 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms