Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn3Q07409 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntn3Q07409 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms