Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smarcad1Q04692 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms