Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kcnb1Q03717 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kcnb1Q03717 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms