Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll3P85442 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms