Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Irx2P81066 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms