Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tuba4aP68368 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tuba4aP68368 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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