Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Rps29P62274 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms