Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RabggtbP53612 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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