Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcntP48725 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcntP48725 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcntP48725 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcntP48725 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PcntP48725 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PcntP48725 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PcntP48725 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PcntP48725 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PcntP48725 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms