Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rfx2P48379 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rfx2P48379 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms