Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk4P30285 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms