Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccnd2P30280 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccnd2P30280 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms