Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kif5cP28738 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif5cP28738 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif5cP28738 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kif5cP28738 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kif5cP28738 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms