Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gjb3P28231 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms