Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo2P25801 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo2P25801 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms