Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NdnP25233 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NdnP25233 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NdnP25233 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NdnP25233 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms