Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aldh1a1P24549 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aldh1a1P24549 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms