Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd247P24161 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms