Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HdcP23738 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HdcP23738 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HdcP23738 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HdcP23738 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HdcP23738 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HdcP23738 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HdcP23738 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HdcP23738 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HdcP23738 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HdcP23738 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms