Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SftpcP21841 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpcP21841 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms