Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnnc2P20801 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnnc2P20801 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms