Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ifrd1P19182 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ifrd1P19182 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ifrd1P19182 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms