Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnnc1P19123 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnnc1P19123 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms