Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt19P19001 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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