Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P18530 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P18530 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P18530 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
P18530 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms