Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Irf1P15314 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Irf1P15314 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms