Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cxcl2P10889 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms