Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
P10404 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
P10404 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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P10404 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
P10404 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
P10404 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
P10404 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
P10404 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
P10404 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
P10404 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
P10404 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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