Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01636 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P01636 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P01636 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01636 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01636 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01636 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P01636 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms