Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pja1O55176 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pja1O55176 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms