Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tnk2O54967 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnk2O54967 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms