Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Limk2O54785 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Limk2O54785 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms